Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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