Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms