Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEDD9Q14511 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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