Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SCARF1Q14162 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SCARF1Q14162 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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