Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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