Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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