Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
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