Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BFSP2Q13515 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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