Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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MKRN4PQ13434 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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