Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CLN3Q13286 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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