Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms