Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK2Q13002 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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