Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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