Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRDP23468 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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