Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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PTPRAP18433 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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PTPRAP18433 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRAP18433 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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