Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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