Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HCN4Q9Y3Q4 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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