Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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MEIS3Q99687 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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