Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CHIC1Q5VXU3 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CHIC1Q5VXU3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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