Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PXDC1Q5TGL8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms