Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RAB6CQ53S08 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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