Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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