Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDKN3Q16667 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms