Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ZNF239Q16600 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
ZNF239Q16600 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ZNF239Q16600 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ZNF239Q16600 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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