Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCBQ16585 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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