Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TWIST1Q15672 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TWIST1Q15672 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TWIST1Q15672 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TWIST1Q15672 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms