Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SHPRHQ149N8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHPRHQ149N8 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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