Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms