Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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