Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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