Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1CQ13936 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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