Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1Q13813 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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