Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
APOFQ13790 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
APOFQ13790 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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APOFQ13790 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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APOFQ13790 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
APOFQ13790 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
APOFQ13790 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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