Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1SQ13698 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms