Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CUL4BQ13620 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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