Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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