Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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