Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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