Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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