Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXC1Q12948 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXC1Q12948 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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