Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms