Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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