Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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BRPF3Q9ULD4 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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BRPF3Q9ULD4 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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