Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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