Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRERF1Q96PN7 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRERF1Q96PN7 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRERF1Q96PN7 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRERF1Q96PN7 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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