Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms