Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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