Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms