Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms