Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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RTN1Q16799 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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RTN1Q16799 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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